Penolakan adalah masalah biasa dalam pesakit pemindahan organ. Mereka mungkin mengalami satu episod penolakan akut atau minggu penolakan kronik, bulan atau tahun selepas pemindahan. Penolakan berlaku apabila sistem imun mengiktiraf organ yang dipindahkan sebagai bukan diri dan serangan itu. Ini boleh dicegah pada tahap tertentu dengan penggunaan immunosuppressants, juga dikenali sebagai ubat anti-penolakan. Terdapat banyak jenis immunosuppressants, seperti azathioprine, cyclosporine, dan prednisone. Ubat ini bertindak dengan menekan sistem imun dan mengurangkan keupayaannya untuk menolak organ itu. Mereka perlu diambil dengan tegas mengikut arahan doktor. Walaupun satu dos terlepas boleh meletakkan pesakit yang mempunyai risiko penolakan organ. Jika pesakit pengalaman penolakan organ, doktor akan menukar jenis ubat, meningkatkan dos atau menambah ubat lain.